选择差额开票的企业收到的专票可以抵扣吗?

不可以，只有一般纳税人才可以抵扣的。

加工费发票可以与进项抵扣吗?

不开发票也要计算销项税额，资料就是你们货运单上的产品和数量，这个税务如果来查，也是查这些的。

分录还是：借：应收帐款或银行存款 贷：主营业务收入 应交税费—应交增值税*(销项税额) 如果是外币结算，还应该按外币按成本位币来算。